A. 反向互補、反向、互補序列有何區別
一、順序不同：
原序列：AATTCCGG，
則反向序列為：GGCCTTAA 就是原序列反過來；
互補序列：TTAAGGCC 就是與原序列互補；
反向互補：CCGGAATT 就是與反向序列互補。
二、概念不同：
互補的概念就是A-T，C--G配對
要將核苷酸序列轉換成反向互補序列，需要用DNASTAR軟體，其中有EditSeq組件。
三、序列編碼不同：
在用DNAMAN的多序列比對時，包括編碼鏈和非編碼連的比對，測序得到的目的片段可能是非編碼鏈（即目的基因的編碼鏈的互補序列），而NCBI中提交的序列都是編碼鏈的序列。
#!usr/bin/perl/-w
print "put in";
$a=<STDIN>;
chomp($a);
@q=split (//,$a);
@p=reverse @q;
foreach my $i (@p){
if ($i eq "A"){print "T";}
elsif ($i eq "T"){print "A";}
elsif ($i eq "G"){print "C";}
elsif ($i eq "C"){print "G";}
}
(1)editseq軟體蘋果電腦擴展閱讀：
利用反向PCR可對未知序列擴增後進行分析，探索鄰接已知DNA片段的序列，並可將僅知部分序列的全長cDNA進行分子克隆，建立全長的DNA探針。適用於基因遊走、轉位因子和已知序列DNA旁側病毒整合位點分析等研究。
用傳統的緩沖液和其他提供者推薦的條件裂解DNA。反向PCR所擴增的片段的大小由PCR擴增片段的大小決定，PCR擴增的實際上限為3-4kb。
能裂解核心區的內切酶使反向PCR只能擴增引物所定模板(依賴於引物)的上游 或上游區，而不裂解核心區的酶則使兩上邊側序列都擴增，並帶有由內切酶和環化類 型決定的接點(例如，互補突頭連接與鈍頭連接)。
B. 全基因合成錢對目的基因序列進行GC含量和重復序列分析的軟體是什麼
1.可以使用在線分析工具RepeatMasker： http://www.repeatmasker.org/，重復序列和CG含量都可以同時分析出來。
2.另外也可以使用DNAstar。下載安裝DNAStar軟體包；打開NAStar軟體包里的EditSeq軟體；在打開的界面里依次點擊File、Open，打開所要分析的序列；用滑鼠選定打開的序列後，依次點擊Goodies、DNAStatistics；此時彈出一個文本框，顯示GC含量等信息。
C. 如何將核苷酸序列轉換成反向互補序列
1、要將核苷酸序列轉換成反向互補序列，需要用DNASTAR軟體，其中有EditSeq組件。用法很簡單，如圖示：
2、原序列：AATTCCGG
則反向序列為：GGCCTTAA 就是原序列反過來；
互補序列：TTAAGGCC 就是與原序列互補；
反向互補：CCGGAATT 就是與反向序列互補。
互補的概念就是A-T，C--G配對