㈠ 如何用NCBI查詢一種蛋白質的分子量
1、電腦瀏覽器網路搜索NCBI,直接點擊圖示鏈接進入。

㈡ 有沒網站可以查食物的蛋白質、熱量、脂肪等成分
在百渡查詢 「食品營養成分表」或者在安卓電子市場可以提供這樣的App下載的。
㈢ 怎麼找到蛋白質作用靶點
首先破壞這個蛋白,看有多少基因被影響,用EMSA試驗篩選其上游的啟動子區域即可
㈣ 怎樣通過PDB網站查詢蛋白質的結構,並繪圖作出其活性中心,二維結構等相關信息
PDB網站的查詢方式其實很簡答,可是輸入ID,也可以直接輸入你要查找的蛋白的英文名字,資料庫提供的都是已經解析的蛋白,因此,裡面會有詳細的介紹該蛋白的各個特徵,包含結構,活性中心以及底物等。結構分析軟體很多,pymol是其中一種,也可以用spdviewer,chimera等等。都可以做出漂亮的圖。
㈤ 在NCBI上查一個基因的mRNA和蛋白質序列,怎麼知道這個基因是含有信號肽的呢哪個地方會說明
NCBI上一般不會有說明,你需要近其他預測信號肽的網站進行分析
比如:
http://psort.ims.u-tokyo.ac.jp/
http://www.cbs.dtu.dk/services/
㈥ 國際著名的三大蛋白質資料庫
國際著名的三大蛋白質資料庫有UniProt資料庫、The Human Protein Atlas資料庫、PhosphoSitePlus資料庫。
1、UniProt資料庫
蛋白組學常用資料庫UniProt(全稱UniProt Protein Resource),建立於1986年,由Swiss-Protein、TrEMBL、PIR-PSD三大蛋白質資料庫聯合成立的,其信息量豐富、資源廣泛,是目前公認的首選免費蛋白質資料庫。
2、The Human Protein Atlas資料庫
The Human Protein Atlas內含近30000種人類蛋白質的組織和細胞分布信息,並提供免費查詢。
瑞典Knut&Alice Wallenberg基金會利用免疫組化技術,檢查每一種蛋白質在人類48種正常組織,20種腫瘤組織,47個細胞系和12種血液細胞內的分布和表達,其結果用至少576張免疫組化染色圖表示,並經專業人員校對和標引,保證染色結果具有充分的代表性。
3、PhosphoSitePlus資料庫
PhosphoSitePlus資料庫是一個由CST和NIH聯合開發的免費資源資料庫,總結歸納了海量通過科學研究發現的蛋白修飾位點,包括磷酸化、甲基化、乙醯化、泛素化等,並且包括一些CST公司發現但未發表的蛋白修飾位點。
該資料庫是動態的、開放的、高度互動並持續更新的。它有助於研究PTMs在正常和病理細胞/組織中的作用,同時它也是發現新的疾病標志物和葯物靶點的有力工具。

性能及歷史
蛋白質資料庫(HPDB),建於2005年5月,動態展示生物大分子立體結構,滑鼠點擊放大分子結構、原子定位、測定原子之間距離,可用於教學或科研。服務對象是能夠熟練使用中文的生命科學、醫學、葯學、農學、林學等領域的大中專學生、教師及科技工作者。
分子結構特徵描述採用漢語,同時提供英文原文以供考證。對於善於使用英文的讀者,我們提倡直接訪問RCSB PDB,一來可以減少網路擁擠,二來可以減少由於HPDB的翻譯不妥帶來的不便。
蛋白質資料庫(HPDB)對每個蛋白質分子結構說明部分做了中文翻譯(最新加入資料庫的分子除外),內容包括分子結構定性描述、樣品的來源、表達載體、宿主、化學分析方法、分子結構組成成分等。這些信息並同蛋白質分子結構數據存儲於資料庫,因此HPDB支持中文查詢。
蛋白質資料庫(HPDB)雖然翻譯了「分子結構說明」部分,但為了保證數據的可靠性和准確性,HPDB對一級結構序列及大分子結構坐標數據等未做任何改動,資料庫保持RCSB PDB核實後的原始實驗數據文件,並保持PDB文件格式和蛋白質分子編號。
㈦ 如何找到蛋白的在細胞上的作用靶點
蛋白水平幾assay先測或者再加細胞水平用pulldown實驗面適部位接biotin影響性基礎看看能能靶向蛋白拉
或者條件用核磁共振鑒定
㈧ 如何利用NCBI查詢蛋白質等電點
NCBI無法查詢蛋白質等電點,可以到swissprot查詢。
這個NCBI沒有相關的功能,這個是以核苷酸序列為主。因為等電點特性是蛋白質水平的分子特性,可以到swissprot進行查詢,查詢蛋白質等電點需要到專業的平台進行查詢。
另外NCBI開發有Genbank等公共資料庫,提供Pubmed、BLAST、Entrez、OMIM、Taxonomy等工具,可對國際分子資料庫和生物醫學文獻進行檢索和分析。

(8)哪個網站可以查蛋白的干擾靶點擴展閱讀:
NCBI開發用於分析基因組數據和傳播生物醫學信息的軟體工具。NCBI支持與推廣多種醫學及科技方面的資料庫,如:三維蛋白質結構的分子模型資料庫(MMDB)、孟德爾人類遺傳(OMIM)等。
另外使用CD-Search工具來可以鑒定蛋白質或者核酸序列內的保守結構域或功能單位。該工具位於NCBI中。可以進入NCBI後選擇ConservedDomain中的Search。
除此之外這個網站Search的黃色部分其中CD-search只能提交單條序列,BatchCD-Search可以上傳多條序列,裡面收錄的數據范圍是比較廣的,可以利用NCBI進行檢索。
