『壹』 簡述camp信號通路的組成及傳導過程。
該通路是由質膜上的五種成分組成：激活型受體(stimulate receptor, RS)，抑制型受體(inhibite receptor, Ri)，激活型和抑制型調節G蛋白(Gs和Gi)和腺苷酸環化酶(adenylate cyclase, AC)。
傳導過程：當細胞沒有受到激素刺激，Gs處於非活化態，α亞基與GDP結合，此時腺苷酸環化酶沒有活性；當激素配體與Rs結合後，導致Rs構象改變，暴露出與Gs結合的位點，使激素-受體復合物與Gs結合，
Gs的α亞基構象改變，從而排斥GDP，結合GTP而活化，使三聚體Gs蛋白解離出α亞基和βγ基復合物，並暴露出α亞基與腺苷酸環化酶的結合位點；結合GTP的α亞基與腺苷酸環化酶結合，使之活化，並將ATP轉化為CAMP。
隨著GTP的水解α亞基恢復原來的構象並導致與腺苷酸環化酶解離，終止腺苷酸環化酶的活化作用。α亞基與βγ亞基重新結合，使細胞回復到靜止狀態。
(1)有效成分作用靶點信號通路網路圖擴展閱讀
CAMP信號通路(cAMP signal pathway)在CAMP信號通路中，Gα亞基的首要效應酶是腺苷酸環化酶（adenylyl cyclase AC），通過腺苷酸環化酶活性的變化調節靶細胞內第二信使CAMP的水平，進而影響信號通路的下游事件。
以cAMP為第二信使的信號通路的主要效應是通過活化cAMP依賴的PKA使下游靶蛋白磷酸化，從而影響細胞代謝和細胞行為，這是細胞快速應答胞外信號的過程。此外，還有一類細胞緩慢應答胞外信號的過程，就是cAMP信號通路對細胞基因表達的影響。
『貳』 最近實驗要做MAPK靶點的信號通路，哪位大神給介紹下相關抑制劑啊
關於MAPK：
絲裂原活化蛋白激酶（mitogen-activated protein kinase，MAPK）是一組能被不同的細胞外刺激，如細胞因子、神經遞質、激素、細胞應激及細胞黏附等激活的絲氨酸-蘇氨酸蛋白激酶。由於MAPK是培養細胞在收到生長因子等絲裂原刺激時被激活而被鑒定的，因而得名。所有的真核細胞都能表達MAPK。MAPK通路的基本組成是一種從酵母到人類都保守的三級激酶模式，包括MAPK激酶激酶（MAP kinasekinase kinase，MKKK）、MAPK激酶（MAP kinase kinase，MKK）和MAPK，這三種激酶能依次激活，共同調節著細胞的生長、分化、對環境的應激適應、炎症反應等多種重要的細胞生理/病理過程。
信號通路圖：
相關抑制劑：
Selumetinib(AZD6244)是一種有效，高選擇性的MEK1抑制劑，IC50為14 nM，也抑制ERK1/2磷酸化，IC50為10 nM，對p38α， MKK6， EGFR， ErbB2， ERK2， B-Raf等沒有抑製作用。Phase 3。
Vemurafenib(PLX4032, RG7204)是一種新型有效的B-RafV600E抑制劑，IC50為31 nM。
SB203580是一種p38 MAPK抑制劑，IC50為0.3-0.5 μM，與SAPK3(106T)和SAPK4(106T)相比選擇性低10倍，且抑制PKB磷酸化，IC50為3-5 μM。
參考：www.selleck.cn/pharmacological_MAPK.html
『叄』 R語言可視化通路富集網路圖
我們輸入的數據包含 gene ID 和 vector(單樣本)部分，這里的 gene ID 是一個通用概念，可以是基因、轉錄本、酶或蛋白質。這里的 vector 可以是樣本的表達量、倍數變化, p-value, 組蛋白修飾數據等可測量的屬性。下面我們以一個 RNA-seq 差異分析後的數據為例，來學習 pathview 的用法。
在 KEGG PATHWAY Database 查詢,例如查詢小鼠的"Cell Cycle"這條通路:
得到通路 ID 為"04110",物種為"mmu"
我們通過指定 gene.data 和 pathway.id 來觀察我們數據里的基因在信號通路「Pathways in cancer」上的表達變化:
相比於原始的 KEGG 圖，我們可以使用 graphviz 產生一個新的布局，並且輸出 PDF 格式的文件:
以下是輸出結果圖
如果我們想要運行的更快一點，並且不介意輸出圖片的大小，我們可以分圖層，用 same.layer = F 將節點顏色和標簽添加到另一個圖層中，並且原來的 KEGG 基因標簽會變成官方的 gene symbols :
在此基礎上，修改 kegg.native = FALSE ，我們就可以得到一個主圖與圖例分成兩個頁面的 PDF 文件
在原始的 KEGG 視圖中，一個基因節點可能代表具有相似或者冗餘功能的基因/蛋白質，我們可以將這種包含多個基因的節點拆分成獨立的節點，這樣可以更好的從基因層面而不是節點層面來查看數據。同時也可以通過匯總基因數據來可視化節點數據:
為了畫面有更好的清晰度和可讀性，默認不分裂節點，也不單獨標記每個成員基因。
代謝途徑中，除了基因節點還有化合物節點，我們可以嘗試利用代謝途徑( Propanoate metabolism)整合基因數據和化合物數據。這里的化合物數據包括代謝物、葯物，對它們的測量和它們的屬性。在這里我們仍然使用之前 RNA-seq 差異分析的數據作為 gene data,然後，我們生成模擬化合物或代謝組數據，並載入適當的化合物 ID 類型以進行演示:
結果如下
pathview 可以集成並將多個樣本或狀態繪製成一個圖，我們可以使用多個重復樣本模擬化合物數據:
結果如下，可以看到基因節點和化合物節點被分成多份，對應不同的樣本:
我們可以根據將化合物數據分為絕對值大於 5 和小於 5 兩類，構成一組離散型數據:
結果如下:
Pathview 包中的主函數是 pathview() ，有著各種參數，是我們用到最多的函數。在這篇文章中，我們介紹了 pathview()的比較常見的用法,包括包安裝，數據准備，以及其他有用的特性。我們也可以使用 pathxiew 的網頁版，地址是 https://pathview.uncc.e/ 。此外，Pathview 在數據整合方面有很強大的功能，包含 4800 個物種，能處理的數據屬性和格式包括 連續/離散數據、矩陣/矢量、單個/多個樣本數據 ，包中還具有強大的 ID 轉換功能，這些都值得我們進一步探索。
生活很好，有你更好
『肆』 細胞配受體通識以及常見細胞分泌信號通路
你認為你的細胞只是簡單的積木，無意識的和靜態的，就像牆上的磚塊?如果是的話，再想想!細胞能夠探測到周圍發生的事情，並且能夠對來自鄰居和環境的提示做出實時反應。此時此刻，你的細胞正在以化學信號分子的形式發送和接收數以百萬計的信息!
在本文中，我們將研究細胞之間如何通信的基本原理。我們將首先了解細胞-細胞信號是如何工作的，然後考慮在我們體內發生的不同種類的短距離和長程信號。
細胞通常使用化學信號進行交流。這些化學信號是由發送細胞產生的蛋白質或其他分子，通常由細胞分泌並釋放到細胞外空間。在那裡，它們可以像漂流瓶一樣漂浮到鄰近的細胞。
並不是所有的細胞都能「聽到」特定的化學信息。為了檢測到一個信號(也就是說，成為一個目標細胞，target cell)，相鄰的細胞必須有合適的受體（receptor ）來接收這個信號。當信號分子與受體結合時，它改變了受體的形狀或活動，觸發了細胞內部的變化。信號分子通常被稱為配體（ligands），配體是專門與其他分子(如受體)結合的分子的總稱。
所以一個細胞在不同的配受體語境下，可能是受體也可能是配體。
配體所攜帶的信息通常通過細胞內的化學信使鏈傳遞。最終，它會喚起細胞的變化，如基因活性的改變，甚至誘導一個完整的過程，如細胞分裂。因此，原始的細胞間(細胞間)信號被轉化為觸發反應的細胞內(細胞內)信號。
你可以在有關配體和受體、信號傳遞和細胞反應的文章中了解更多這是如何工作的。
就像千里之行始於足下一樣，細胞內部復雜的信號通路也始於一個關鍵事件——信號分子或配體（Ligands ）與接收分子或受體（receptors ）結合。
受體和配體有很多種形式，但它們都有一個共同點:它們都是緊密匹配的配對，一個受體只能識別一個(或幾個)特定的配體，一個配體只能與一個(或幾個)目標受體結合。配體與受體結合會改變受體的形狀或活性，使其能夠傳遞信號或直接在細胞內部產生變化
在這一節中，我們將研究不同類型的受體和配體，看看它們是如何相互作用，將細胞外的信息轉化為細胞內的變化。
受體有很多種，但可分為兩類:細胞內受體，即存在於細胞內部(細胞質或細胞核中);細胞表面受體，即存在於質膜中。
細胞內受體是在細胞內部發現的受體蛋白，通常在細胞質或細胞核中。在大多數情況下，細胞內受體的配體是小的疏水(憎水)分子，因為它們必須能夠穿過質膜才能到達受體。例如，疏水類固醇激素，如性激素雌二醇(雌激素)和睾酮的主要受體是細胞內的。
當一種激素進入細胞並與受體結合時，它會導致受體改變形狀，從而使受體-激素復合物進入細胞核(如果已經不存在的話)並調節基因活性。激素結合暴露了受體中具有DNA結合活性的區域，這意味著它們可以附著在特定的DNA序列上。這些序列被發現在細胞DNA的某些基因旁邊，當受體與這些基因結合時，它改變了它們的轉錄水平。
許多信號通路，包括細胞內和細胞表面受體，導致基因轉錄的變化。然而，細胞內受體是獨特的，因為它們非常直接地引起這些變化，與DNA結合並改變轉錄本身。
細胞表面受體是與細胞外表面配體結合的膜錨定蛋白。在這種類型的信號傳導中，配體不需要穿過質膜。因此，許多不同種類的分子(包括大分子、親水分子或「親水」分子)可以作為配體。
一個典型的細胞表面受體有三個不同的區域，即蛋白質區域:一個細胞外(「細胞外」)配體結合區域，一個延伸細胞膜的疏水區域，以及一個通常傳遞信號的細胞內(「細胞內」)區域。這些區域的大小和結構取決於受體的類型，疏水區域可能由交叉在細胞膜上的多個氨基酸延伸組成。
細胞表面受體有很多種，但在這里我們將看到三種常見的類型:配體門控離子通道，G蛋白偶聯受體，受體酪氨酸激酶。
配體門控離子通道是指隨著配體的結合而打開的離子通道。為了形成通道，這種類型的細胞表面受體有一個跨膜區域，中間有一個親水(親水)通道。該通道允許離子通過膜而不必接觸磷脂雙分子層的疏水性核心。
當一個配體結合到細胞外區域的通道,蛋白質的結構發生變化,這樣一個特定類型的離子,如 Ca2+或Cl−可以通過。在某些情況下，事實正好相反：通道通常是打開的，配體結合使其關閉。細胞內離子水平的變化可以改變其他分子的活性，如離子結合酶和電壓敏感通道，以產生反應。神經元或神經細胞有配體門控通道，這些通道被神經遞質結合。
蛋白偶聯受體(GPCRs)是一個龐大的細胞表面受體家族，具有共同的結構和信號傳導方式。GPCR家族的成員都有七個不同的蛋白質片段穿過細胞膜，它們通過一種叫做G蛋白的蛋白質在細胞內傳遞信號。
酶聯受體是一種細胞表面受體，具有與酶相關的胞內結構域。在某些情況下，受體的細胞內區域實際上是一種可以催化反應的酶。其他酶聯受體有一個與酶5^5相互作用的胞內結構域。
受體酪氨酸激酶(RTKs)是一類在人類和許多其他物種中發現的酶聯受體。激酶只是一種酶的名稱，它把磷酸基轉移到蛋白質或其他目標上，而受體酪氨酸激酶專門把磷酸基轉移到氨基酸酪氨酸上。
配體由信號細胞產生，並與靶細胞內或靶細胞上的受體相互作用，有許多不同的種類。有些是蛋白質，有些是疏水分子，比如類固醇，還有一些是氣體，比如一氧化氮。在這里，我們將看一些不同類型的配體的例子。我們熟悉的類固醇激素包括女性性激素雌二醇(雌激素的一種)和男性性激素睾酮。維生素D是在皮膚中利用光的能量合成的一種分子，它是類固醇激素的另一個例子。因為它們是疏水性的，這些激素在穿過細胞膜時沒有困難，但它們必須與載體蛋白質結合才能通過(水)血液。
水溶性配體是極性的或帶電荷的，不能輕易穿過質膜。因此，大多數水溶性配體結合到細胞表面受體的細胞外區域，停留在細胞的外表面。肽(蛋白質)配體是水溶性配體中數量最多、種類最多的一類。例如，生長因子、胰島素等激素和某些神經遞質都屬於這一類。肽配體的長度可以從幾個氨基酸(如鎮痛腦啡肽)到上百個或更多的氨基酸。
小的疏水配體可以通過質膜並與細胞核或細胞質中的細胞內受體結合。在人體中，這類最重要的配體是類固醇激素。
當一個細胞的信號分子(配體)與另一個細胞的受體結合，信號傳遞過程完成了嗎?
如果我們說的是細胞內受體，它們在細胞內結合配體並直接激活基因，答案可能是肯定的。然而，在大多數情況下，答案是否定的——絕不可能!對於位於細胞膜上的受體來說，信號必須通過細胞中的其他分子傳遞，就像一種「電話」的細胞游戲。
在細胞內傳遞信號的分子鏈被稱為細胞內信號轉導途徑。在這里，我們將看到細胞內信號轉導途徑的一般特徵，以及在這些途徑中常用的一些中繼機制。
當配體與細胞表面受體結合時，受體的細胞內結構域(細胞內的一部分)會以某種方式改變。通常，它會呈現出一種新的形狀，這可能使它具有酶的活性，或者使它與其他分子結合。
受體的變化引發了一系列的信號傳遞事件。例如，受體可能打開細胞內的另一個信號分子，反過來激活它自己的目標。這種連鎖反應最終會導致細胞行為或特性的改變，如下圖所示。
由於信息的流向是有方向性的，上游（upstream ）這個術語通常用來描述在接力鏈中較早出現的分子和事件，而下游（upstream ）則可以用來描述那些較晚出現的分子和事件(相對於特定的感興趣的分子)。例如，在圖中，受體在配體的下游但在細胞質蛋白質的上游。許多信號轉導途徑將初始信號放大，使得一個配體分子可以導致下游靶點的多個分子的激活。
傳遞信號的分子通常是蛋白質。然而，離子和磷脂等非蛋白分子也可以發揮重要作用。
上面的卡通特徵是一堆標記為「開」或「關」的斑點(信號分子)。「一個斑點的開或關到底是什麼意思?」活化或滅活蛋白質的方法多種多樣。然而，改變蛋白質活性最常見的方法之一是在蛋白質的一個或多個位點上添加一個磷酸基，這個過程稱為磷酸化。
磷酸化通常起到開關的作用，但其作用在不同的蛋白質中有所不同。有時，磷酸化會使蛋白質更活躍(例如，增加催化作用或使其與夥伴結合)。在其他情況下，磷酸化可能使蛋白質失活或導致其分解。
一般來說，磷酸化不是永久的。為了將蛋白質翻轉回非磷酸化狀態，細胞中有一種被稱為磷酸酶的酶，它可以將一個磷酸基從它們的目標上移除。
https://www.khanacademy.org/science/biology/cell-signaling/mechanisms-of-cell-signaling/v/example-of-signal-transction-pathway
凡請背誦以下名詞解釋,並注意各個通路之間的關系。
Pancreatic cancers with aberrant expression of macrophage migration inhibitory factor (MIF) are particularly aggressive. To identify key signaling pathways that drive disease aggressiveness in tumors with high MIF expression, we analyzed the expression of coding and noncoding genes in high and low MIF-expressing tumors in multiple cohorts of pancreatic ctal adenocarcinoma (PDAC) patients.
Transforming growth factor-β (TGF-β) superfamily signaling plays a critical role in the regulation of cell growth, differentiation, and development in a wide range of biological systems. In general, signaling is initiated with ligand-inced oligomerization of serine/threonine receptor kinases and phosphorylation of the cytoplasmic signaling molecules Smad2 and Smad3 for the TGF-β/activin pathway, or Smad1/5/9 for the bone morphogenetic protein (BMP) pathway.
B- and T-lymphocyte attenuator (BTLA) is an immune-regulatory receptor, similar to CTLA-4 and PD-1, and is mainly expressed on B-, T-, and all mature lymphocyte cells. Herpes virus entry mediator (HVEM)-BTLA plays a critical role in immune tolerance and immune responses which are areas of intense research. However, the mechanisms of the BTLA and the BTLA/HVEM signaling pathway in human diseases remain unclear. This review describes the research milestones of BTLA and HVEM in chronological order and their role in chronic HBV infection.
Bone Morphogenetic Proteins (BMPs) are a group of signaling molecules that belongs to the Transforming Growth Factor-β (TGF-β) superfamily of proteins. Initially discovered for their ability to ince bone formation, BMPs are now known to play crucial roles in all organ systems. BMPs are important in embryogenesis and development, and also in maintenance of alt tissue homeostasis.
After the initial discovery of activins as important regulators of reproction, novel and diverse roles have been unraveled for them. Activins are expressed in various tissues and have a broad range of activities including the regulation of gonadal function, hormonal homeostasis, growth and differentiation of musculoskeletal tissues, regulation of growth and metastasis of cancer cells, proliferation and differentiation of embryonic stem cells, and even higher brain functions. Activins signal through a combination of type I and II transmembrane serine/threonine kinase receptors. Activin receptors are shared by multiple transforming growth factor-β (TGF-β) ligands such as myostatin, growth and differentiation factor-11 and nodal.
Neuregulin 1 (NRG-1) and its receptor ErbB4 have emerged as biologically plausible schizophrenia risk factors, molators of GABAergic and dopaminergic neurotransmission, and as potent regulators of glutamatergic synaptic plasticity. NRG-1 acutely depotentiates LTP in hippocampal slices, and blocking ErbB kinase activity inhibits LTP reversal by theta-pulse stimuli (TPS), an activity-dependent reversal paradigm. NRG-1/ErbB4 signaling in parvalbumin (PV) interneurons has been implicated in inhibitory transmission onto pyramidal neurons.
FGF was identified forty years ago and has been extensionally studied over the last three decades ( 23 ). There are 22 human FGFs, which are encoded by different genes. It has been known that most FGFs are secreted and contain signal-peptide sequences ( 23 ). Structurally, the FGF protein has FGFR-binding domains and HS (heparin sulfate)-binding domains, which is required for FGFR dimerization and activation
Platelet-derived growth factor (PDGF) signaling network consists of four ligands, PDGFA-D, and two receptors, PDGFRalpha and PDGFRbeta. All PDGFs function as secreted, disulphide-linked homodimers, but only PDGFA and B can form functional heterodimers.
The VEGF (vascular endothelial growth factor) signaling pathway regulates vascular development in the embryo (vasculogenesis) and new blood vessel formation (angiogenesis). The VEGFR can ince several cellular processes which are common to many growth factor receptors, including cell migration, proliferation and survival.
Despite a strong preclinical rationale for targeting the insulin-like growth factor (IGF) axis in cancer, clinical studies of IGF-1 receptor (IGF-1R)-targeted monotherapies have been largely disappointing, and any potential success has been limited by the lack of validated predictive biomarkers for patient enrichment. A large body of preclinical evidence suggests that the key role of the IGF axis in cancer is in driving treatment resistance, via general proliferative/survival mechanisms, interactions with other mitogenic signaling networks, and class-specific mechanisms such as DNA damage repair.
Tumor necrosis factor (TNF) is a kind of cytokine with many biological effects. It promotes cell growth, differentiation, apoptosis and inflammation by binding to specific receptors on the cell membrane. TNF-α belongs to the TNF family and can activate ERK (extracellular signal 2 regulated protein kinase), Caspase protease, and JNK. It also has independent pathways to achieve its biological functions such as cytotoxicity, antiviral, immune regulation and apoptosis. Since TNF-α is directly related to cell homeostasis and many human diseases, such as tumors, research on TNF-α signaling pathway has become a hot topic in biomedical research in the past decade.
The LIFR gene provides instructions for making the leukemia inhibitory factor receptor (LIFR) protein. This receptor spans the cell membrane, which allows it to attach (bind) to other proteins, called ligands, outside the cell and send signals inside the cell that help the cell respond to its environment. Ligands and receptors fit together like keys into locks.
The CSF-1 receptor (CSF-1R) is activated by the homodimeric growth factors colony-stimulating factor-1 (CSF-1) and interleukin-34 (IL-34). It plays important roles in development and in innate immunity by regulating the development of most tissue macrophages and osteoclasts, of Langerhans cells of the skin, of Paneth cells of the small intestine, and of brain microglia. It also regulates the differentiation of neural progenitor cells and controls functions of oocytes and trophoblastic cells in the female reproctive tract.
As essential mediators of red cell proction, erythropoietin (EPO) and its cell surface receptor (EPO receptor [EPOR]) have been intensely studied. Early investigations defined basic mechanisms for hypoxia-incible factor inction of EPO expression, and within erythroid progenitors EPOR engagement of canonical Janus kinase 2/signal transcer and activator of transcription 5 (JAK2/STAT5), rat sarcoma/mitogen-activated protein kinase/extracellular signal-regulated kinase (RAS/MEK/ERK), and phosphatidylinositol 3-kinase (PI3K) pathways.
Meiosis is of prime importance for successful gametogenesis, and insufficient maintenance of oocyte meiotic arrest compromises oocyte developmental competence. Recent studies have demonstrated that the C-type natriuretic peptide (CNP)-Natriuretic peptide receptor 2 (NPR2) pathway can inhibit mammalian oocyte meiotic resumption. In mouse and porcine, the inhibitory effect of mural granulosa cell (MGC)-derived CNP on oocyte meiotic resumption is mediated by NPR2 localized in cumulus cells (CCs) surrounding the oocytes. However, in the present study, we identified a novel mechanism for CNP-inced meiotic arrest that appears to be unique to bovine oocytes.
Proteinase-activated receptors (PARs) are a subfamily of G protein-coupled receptors (GPCRs) with four members, PAR1, PAR2, PAR3 and PAR4, playing critical functions in hemostasis, thrombosis, embryonic development, wound healing, inflammation and cancer progression.
During central nervous system development, extracellular matrix (ECM) receptors and their ligands play key roles as guidance molecules, informing neurons where and when to send axonal and dendritic projections, establish connections, and form synapses between pre- and postsynaptic cells. Once stable synapses are formed, many ECM receptors transition in function to control the maintenance of stable connections between neurons and regulate synaptic plasticity.
『伍』 graph包：圓狀網路圖的繪制|互作網路圖|基因通路網路圖
事情是這樣的，有小夥伴給了一張圖，是個GO與基因關系的網路圖，問怎麼做，因為是截圖，所有這里我放自己做的圖。是這樣的：
為了鼓搗這個圖也是費了一番功夫，這種網路圖與ggtree這些是同源的感覺，是不過是曲線而已，主要是用ggraph包。重點在於構建作圖數據。大類用大的節點，放在圓內部，周圍一圈是節點，外部點的大小這里我用的是基因的P值，實際中可以用實際的數據。這個圖的用處，我想到的有：（1）這種通絡富集圖，展示通路下包含的基因。（2）蛋白互作。（3）單細胞中每個細胞類群包含的亞群也可以用這個圖展示。
很吊胃口吧！！！！
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『陸』 說明g蛋白偶聯受體介導的信號通路！簡潔的~急啊！！！跪謝！！！
由G蛋白偶聯受體所介導的細胞信號通路主要包括：cAMP信號通路和磷脂醯肌醇信號通路
1.
cAMP信號通路
細胞外信號與相應受體結合，導致細胞內第二信使cAMP的水平變化而引起細胞反應的信號通路。這一信號通路的首要效應酶是腺苷酸環化酶，通過腺苷酸環化酶調節胞內cAMP的水平。cAMP可被磷酸二酯酶限制性地降解消除。cAMP信號通路的主要效應是激活靶酶和開啟基因表達，這是通過蛋白激酶A完成的。蛋白激酶A由兩個催化亞基和兩個調節亞基組成，在沒有cAMP時，以鈍化復合體形式存在。cAMP與調節亞基結合，改變調節亞基構象，使調節亞基和催化亞基解離，釋放催化亞基。活化的蛋白激酶A催化亞基可使細胞內某些蛋白的絲氨酸或蘇氨酸殘基磷酸化，於是改變蛋白的活性。
2.
磷脂醯肌醇信號通路
胞外信號分子與細胞表面G蛋白偶聯受體結合，激活質膜上的磷脂酶C（PLC），使質膜上4，5-二磷酸磷脂醯肌醇（PIP2）水解成1，4，5-三磷酸肌醇（IP3）和二醯基甘油（DG）兩個第二信使，使胞外信號轉換為胞內信號。IP3動員細胞內源鈣到細胞質，使胞內Ca2+濃度升高；DG激活蛋白激酶C（PKC），活化的PKC進一步使底物磷酸化，並可激活Na+/H+交換引起細胞內pH升高。以磷脂醯肌醇代謝為基礎的信號通路的最大特點是胞外信號被膜受體接受後，同時產生兩個胞內信使，分別激動兩個信號傳遞途徑即IP3-Ca2+和DG-PKC途徑，實現細胞對外界信號的應答，因此把這一信號系統有稱之為「雙信號系統」。
3.
cGMP信號通路
與cAMP信使系統相似點：由GC催化產生，PDE酶催化滅活。受體鳥苷酸環化酶的配體是心房肌肉細胞分泌的一組肽類激素心房排鈉肽（ANPs）。當血壓升高時，心房細胞分泌ANPs，促使腎細胞排水、排鈉，同時導致血管平滑肌細胞鬆弛，結果使血壓下降。介導ANP反應的受體分布在腎和血管平滑肌細胞表面。ANPs與受體結合直接激活胞內段鳥苷酸環化酶的活性，使GTP轉化為cGMP，cGMP作為第二信使結合並激活cGMP依賴的蛋白激酶G（PKG），導致靶細胞的絲氨酸/蘇氨酸殘基活化
『柒』 網路葯理學如何寫論文
網路葯理學寫論文的材料素材：
1、從要研究的方劑/中葯中獲得有效成分。
2、根據有效成分預測靶基因。
3、根據表型獲得對應的靶基因。
4、有效成分對應的靶基因與表型對應的靶基因取交集。
5、構建中葯/方劑有效成分靶基因網路。
寫作技巧
基於系統生物學的理論，對生物系統的網路分析，選取特定信號節點(Nodes)進行多靶點葯物分子設計的新學科。網路葯理學強調對信號通路的多途徑調節，提高葯物的治療效果，降低毒副作用，從而提高新葯臨床試驗的成功率，節省葯物的研發費用。
其中中葯/方劑通過某某基因調節某某通路治療表型的研究，研究側重於細節研究，把網路葯理學當作篩選靶基因、通路的手段，再用常規的分子生物學、細胞生物學的技術加以驗證。如果研究細節到位，可以沖擊3-10分作用的SCI期刊。
『捌』 如何用ppt畫出生物醫學中各種信號通路示意圖
用來用去還是photoshop好用。多從文獻上找些素材，借鑒一下可以畫出很好的。
就我的經驗來看，這幅圖應該是在2003版本的Powerpoint中完成的。
Powerpoint中使用的圖往往分為兩種，一種是手工繪制的圖形，一種是插入的圖片素材。
在這幅圖中，橙色雲狀部分、六邊形部分、上面的藍色橫條以及各個連接線條是採用手工繪制的；而伺服器、計算機、網路信號塔等圖標則是插入的外部圖片素材。
手工繪制部分很簡單，PPT的自定義圖形中有專門的雲形，選中之後拖動滑鼠繪制出合適大小的雲形，再填充橙色、添加陰影即可；六邊形也有專門的圖形，只不過要做到圖上的效果，在繪制完畢之後還需要設置3D格式，做出立體感；
而作為插入PPT中使用的素材，如果直接使用平常我們看到的點陣圖（比如照片），顏色可能五顏六色，而且也會有不想要的背景，要使用還得自己摳圖，相當不方便。所以在實際操作中，經常被使用的是一些圖標素材（ICON），圖標素材不是照片，而是電腦繪制的美工作品，具有解析度高、主體突出、無需摳圖等特點，如果能有幸找到成套的ICON，還可以保證風格上的一致性，下載之後直接插入PPT，縮放到合適大小即可，方便快捷，建議在製作過程中優先使用。
『玖』 經典信號通路之Wnt信號通路
1、Wnt 信號通路 簡介
Wnt信號通路是一個復雜的 蛋白質 作用網路，其功能最常見於胚胎發育和癌症， 但也參與成年動物的正常生理過程.
2、Wnt信號通路的發現
Wnt得名於Wg (wingless) 與Int.wingless 基因最早在果蠅中被發現並作用於 胚胎 發育，以及成年動物的肢體形成INT 基因最早在脊椎動物中發現，位於小鼠乳腺腫瘤病毒(MMTV)整合位點附近。Int-1 基因與 wingless 基因具有同源性。
果蠅中 wingless 基因突變 可導致無翅畸形，而 小鼠乳腺腫瘤中MMTV復制並整合入基因組可導致一種或幾種Wnt基因合成增加。
3、Wnt信號通路的機制
Wnt信號通路 包括許多可調控Wnt信號分子合成的蛋白質，它們與靶細胞上的受體相互作用，而靶細胞的生理反應則來源與細胞和胞外Wnt配體的相互作用。盡管發應的發生及強度因Wnt配體， 細胞種類 及機體自身而異，信號通路中某些成分，從線蟲到人類都具有很高的同源性。蛋白質的同源性提示多種各異的Wnt配體來源於各種生物的共同祖先。
經典Wnt通路描述當Wnt蛋白於細胞表面Frizzled受體家族結合後的一系列反應，包括Dishevelled受體家族蛋白質 的激活及最終細胞核內β-catenin水平的變化。 Dishevelled (DSH) 是細胞膜相關Wnt受體復合物的關鍵成分，它與Wnt結合後被激活，並抑制下游蛋白質復合物，包括axin、GSK-3、與APC蛋白。axin/GSK-3/APC 復合體可促進 細胞內 信號分子β-catenin的降解。當「β-catenin 降解復合物」被抑制後，胞漿內的β-catenin得以穩定存在，部分 β-catenin進入細胞核與TCF/LEF轉錄因子家族作用並促進特定基因的表達。
4、Wnt介導的 細胞 反應
經典Wnt信號通路介導的重要細胞反應包括：
癌症發生。Wnts, APC, axin，與 TCFs表達水平的變化均與癌症發生相關。
體軸發育。在蟾蜍卵內注射Wnt抑制劑可導致雙頭畸形。
形態發生。
wingless-type MMTV integration site family, member 1
識別
符號WNT1
替換符號INT1
Entrez 7471
HUGO 12774
OMIM 164820
RefSeq NM_005430
UniProt P04628
其他資料
基因座 12 q13
wingless-type MMTV integration site family, member 2
識別
符號WNT2
替換符號INT1L1
Entrez 7472
HUGO 12780
OMIM 147870
RefSeq NM_003391
UniProt P09544
其他資料
基因座 7 q31
wingless-type MMTV integration site family, member 6
識別
符號WNT6
Entrez 7475
OMIM 604663
RefSeq NM_006522
其他資料
基因座 2 q35
參考資料：
1. ^ D. C. Lie, S. A. Colamarino, H. J. Song, L. Desire, H. Mira, A. Consiglio, E. S. Lein, S. Jessberger, H. Lansford, A. R. Dearie and F. H. Gage (2005) "Wnt signalling regulates alt hippocampal neurogenesis" in Nature Volume 437, pages 1370-1375.Template:Entrez Pubmed.
2. ^ F. Rijsewijk, M. Schuermann, E. Wagenaar, P. Parren, D. Weigel and R. Nusse (1987) "The Drosophila homolog of the mouse mammary oncogene int-1 is identical to the segment polarity gene wingless" in Cell Volume 50, pages 649-657.Template:Entrez Pubmed.
3. ^ C. Nusslein-Volhard and E. Wieschaus (1980) "Mutations affecting segment number and polarity in Drosophila" in Nature Volume 287, pages 795-801.Template:Entrez Pubmed.